サンゴ礁を持つ島嶼世界は人間の居住がはじまって数千年ほどの歴史を持ちますが、微妙な均衡状態にあった陸上生態系やサンゴ礁生態系が人間の営為によって随時変化してきたことがこれまでの考古学的研究によって明らかになりつつあります。
現在見られるサンゴ礁は、完新世の環境変動の営力と人間の営為が絡み合うことによって生み出された歴史的産物といえます。

本計画研究では、計画研究B01と連携しながら、その長期的なダイナミクスを解明した上で、サンゴ礁と人間の新たな共生・共存系のモデルを構築します。
そのために、ジオ考古学、動物考古学、形質人類学の手法によって環境利用史（漁労や農耕）を解明します。
また、現在のサンゴ礁が直面する複合ストレスの規模や強度は、過去のものとは比較にならないほど大きいため、この状況への対応策の1つとして、グローバル化のなかで拡大し続ける社会的ネットワークの活用を考えます。
先史時代から連綿と続けられてきた移住や移民を避難や難民としてネガティブに捉えるのではなく、生活資源として活用しうる生態系の拡大戦略として位置づけ、文化人類学的手法によってネットワークの形成･展開の歴史的過程を明らかにします。
これを、複合ストレスに対するサンゴ礁の応答を検討する計画研究C01、計画研究C02の成果と合わせて、サンゴ礁の維持に適切な人口配置を検討します。
最終的には、先史から現在まで連綿と続く「絡み合う人と自然の景観史」を描出し、生計資源･観光資源･ 文化資源としてのサンゴ礁の活用方法を諸学との協働によって探求します。